Le continent africain, touché par une deuxième vague du Covid-19 due à de nouveaux variants du virus, doit renforcer la vigilance.
Le Sars-CoV-2, nom officiel du nouveau coronavirus identifié le 9 janvier 2020 dans la ville de Wuhan, chef-lieu de la province du Hubei en Chine, connait à ce jour environ 4 000 mutations. Ces mutations permettent souvent au virus de pouvoir échapper à une réponse immunitaire développée par une personne ou par une substance thérapeutique.
Un professeur en santé mondiale, infection et immunité à l'Université d'Edimbourg, Francisca Mutapi, a indiqué qu'il est difficile de connaître le nombre total de variants circulant en Afrique parce que ne disposant pas d'une surveillance systématique de séquençage provenant de tous les pays.
À ce jour, il existe un peu moins de 5000 séquences publiquement disponibles provenant de 24 des 47 pays de la Région africaine de l'OMS. À l'aide de ces données, nous avons identifié 145 lignées de la Région. Parmi ces lignées, le variant préoccupant actuellement est le B.1.351 ou le 501Y.V2, qui a d'abord été identifié en Afrique du Sud, et s'est retrouvé au Botswana, en Gambie et en Zambie, a déclaré Dr Francisca Mutapi.
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Ces variants facilitent l'infection. « On estime que ces variants augmentent la capacité de fixation au récepteur sur les cellules humaines et favorisent la transmission », a-t-elle déclaré.
Ces mutations de virus modifient une caractéristique importante du virus, telles que sa capacité à infecter différents hôtes, son taux de transmission, sa capacité à contourner le système immunitaire de l'hôte, les vaccins, les diagnostics et les thérapeutiques, la cause de la pathologie ou la sévérité de la maladie, a-t-elle soutenu.
En termes d'immunité naturelle ou de thérapeutiques utilisant la mémoire immunitaire, « les mutations dans la protéine spirale de B.1.351 ou 501Y.V2 peuvent réduire la reconnaissance du virus par les anticorps, réduire l'efficacité d'un vaccin dirigé contre la protéine spiculaire, mais n'annulent pas ses effets ».
Actuellement, la plupart des vaccins contre la COVID-19 cible la protéine spiculaire. Certains vaccins, tels que les vaccins à virus inactivés développés en Chine, ciblent l'ensemble du virus. Les vaccins inactivés ciblent un ensemble encore plus large de protéines virales, provoquant plusieurs réponses immunitaires protectrices. À ce jour, il n'existe pas d'indication que les mutations identifiées dans les variants B.1.351 ou 501Y.V2 affectent la fonction des médicaments.
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Pour renforcer leurs ripostes aux variants du SARS-COV-2 qui circulent actuellement, les pays africains ont besoin de moyens et approches contextualisées afin de mettre en place les stratégies d'atténuation recommandées pour la prévention et le contrôle des infections, ainsi que la gestion clinique des patients.
